Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP5F1P24539 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP5F1P24539 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms