Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GADD45AP24522 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms