Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTMSP20962 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTMSP20962 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTMSP20962 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTMSP20962 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTMSP20962 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTMSP20962 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTMSP20962 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTMSP20962 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTMSP20962 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTMSP20962 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTMSP20962 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTMSP20962 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTMSP20962 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTMSP20962 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTMSP20962 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTMSP20962 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTMSP20962 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTMSP20962 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTMSP20962 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTMSP20962 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTMSP20962 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTMSP20962 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTMSP20962 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTMSP20962 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTMSP20962 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTMSP20962 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTMSP20962 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTMSP20962 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTMSP20962 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTMSP20962 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTMSP20962 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTMSP20962 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTMSP20962 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTMSP20962 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTMSP20962 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTMSP20962 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTMSP20962 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTMSP20962 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTMSP20962 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTMSP20962 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTMSP20962 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTMSP20962 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTMSP20962 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTMSP20962 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTMSP20962 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTMSP20962 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTMSP20962 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTMSP20962 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTMSP20962 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTMSP20962 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTMSP20962 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PTMSP20962 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTMSP20962 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTMSP20962 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTMSP20962 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTMSP20962 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTMSP20962 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTMSP20962 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTMSP20962 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTMSP20962 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTMSP20962 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTMSP20962 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTMSP20962 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTMSP20962 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTMSP20962 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTMSP20962 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTMSP20962 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTMSP20962 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTMSP20962 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTMSP20962 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTMSP20962 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTMSP20962 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTMSP20962 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTMSP20962 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTMSP20962 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTMSP20962 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTMSP20962 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTMSP20962 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTMSP20962 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTMSP20962 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTMSP20962 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTMSP20962 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTMSP20962 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTMSP20962 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTMSP20962 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTMSP20962 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTMSP20962 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTMSP20962 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTMSP20962 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTMSP20962 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTMSP20962 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTMSP20962 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTMSP20962 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTMSP20962 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTMSP20962 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTMSP20962 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTMSP20962 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTMSP20962 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTMSP20962 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms