Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RASA1P20936 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RASA1P20936 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RASA1P20936 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RASA1P20936 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RASA1P20936 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RASA1P20936 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RASA1P20936 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RASA1P20936 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RASA1P20936 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RASA1P20936 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RASA1P20936 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RASA1P20936 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RASA1P20936 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RASA1P20936 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RASA1P20936 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RASA1P20936 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RASA1P20936 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RASA1P20936 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RASA1P20936 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RASA1P20936 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RASA1P20936 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RASA1P20936 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RASA1P20936 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RASA1P20936 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RASA1P20936 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RASA1P20936 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RASA1P20936 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RASA1P20936 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RASA1P20936 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RASA1P20936 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RASA1P20936 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RASA1P20936 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RASA1P20936 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RASA1P20936 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASA1P20936 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASA1P20936 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASA1P20936 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASA1P20936 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASA1P20936 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RASA1P20936 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RASA1P20936 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RASA1P20936 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RASA1P20936 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RASA1P20936 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RASA1P20936 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RASA1P20936 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RASA1P20936 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RASA1P20936 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RASA1P20936 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RASA1P20936 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RASA1P20936 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RASA1P20936 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RASA1P20936 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RASA1P20936 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RASA1P20936 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RASA1P20936 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RASA1P20936 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASA1P20936 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RASA1P20936 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASA1P20936 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASA1P20936 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASA1P20936 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASA1P20936 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASA1P20936 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASA1P20936 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASA1P20936 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASA1P20936 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASA1P20936 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RASA1P20936 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASA1P20936 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASA1P20936 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASA1P20936 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASA1P20936 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RASA1P20936 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASA1P20936 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RASA1P20936 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASA1P20936 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RASA1P20936 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASA1P20936 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RASA1P20936 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASA1P20936 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASA1P20936 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASA1P20936 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASA1P20936 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASA1P20936 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASA1P20936 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASA1P20936 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASA1P20936 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RASA1P20936 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RASA1P20936 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASA1P20936 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASA1P20936 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RASA1P20936 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RASA1P20936 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RASA1P20936 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RASA1P20936 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RASA1P20936 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RASA1P20936 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RASA1P20936 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms