Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP4AP20648 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP4AP20648 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP4AP20648 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP4AP20648 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP4AP20648 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP4AP20648 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP4AP20648 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP4AP20648 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP4AP20648 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP4AP20648 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP4AP20648 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP4AP20648 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP4AP20648 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP4AP20648 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP4AP20648 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP4AP20648 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP4AP20648 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP4AP20648 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP4AP20648 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP4AP20648 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP4AP20648 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP4AP20648 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP4AP20648 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP4AP20648 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP4AP20648 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP4AP20648 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP4AP20648 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP4AP20648 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP4AP20648 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP4AP20648 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP4AP20648 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms