Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ITGB5P18084 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGB5P18084 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms