Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPCAMP16422 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPCAMP16422 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPCAMP16422 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPCAMP16422 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms