Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPGDP15428 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPGDP15428 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPGDP15428 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPGDP15428 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPGDP15428 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPGDP15428 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPGDP15428 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPGDP15428 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPGDP15428 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPGDP15428 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPGDP15428 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPGDP15428 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPGDP15428 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPGDP15428 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPGDP15428 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPGDP15428 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPGDP15428 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPGDP15428 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPGDP15428 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPGDP15428 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPGDP15428 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPGDP15428 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPGDP15428 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPGDP15428 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPGDP15428 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPGDP15428 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPGDP15428 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPGDP15428 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPGDP15428 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPGDP15428 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPGDP15428 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPGDP15428 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPGDP15428 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPGDP15428 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPGDP15428 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPGDP15428 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPGDP15428 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPGDP15428 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPGDP15428 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPGDP15428 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPGDP15428 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HPGDP15428 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPGDP15428 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPGDP15428 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPGDP15428 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPGDP15428 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPGDP15428 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPGDP15428 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPGDP15428 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPGDP15428 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPGDP15428 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPGDP15428 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPGDP15428 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPGDP15428 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPGDP15428 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPGDP15428 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPGDP15428 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPGDP15428 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPGDP15428 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HPGDP15428 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPGDP15428 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPGDP15428 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPGDP15428 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPGDP15428 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPGDP15428 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPGDP15428 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPGDP15428 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPGDP15428 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPGDP15428 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPGDP15428 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPGDP15428 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPGDP15428 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HPGDP15428 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HPGDP15428 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPGDP15428 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPGDP15428 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms