Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPBP14678 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPBP14678 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPBP14678 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPBP14678 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPBP14678 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPBP14678 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPBP14678 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPBP14678 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPBP14678 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPBP14678 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPBP14678 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPBP14678 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPBP14678 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPBP14678 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPBP14678 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPBP14678 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPBP14678 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPBP14678 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPBP14678 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNRPBP14678 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNRPBP14678 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPBP14678 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPBP14678 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPBP14678 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPBP14678 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPBP14678 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPBP14678 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPBP14678 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPBP14678 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNRPBP14678 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNRPBP14678 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNRPBP14678 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNRPBP14678 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPBP14678 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPBP14678 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPBP14678 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms