Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS3P13797 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS3P13797 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLS3P13797 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLS3P13797 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS3P13797 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS3P13797 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS3P13797 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS3P13797 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS3P13797 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS3P13797 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS3P13797 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS3P13797 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS3P13797 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS3P13797 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS3P13797 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS3P13797 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS3P13797 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS3P13797 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS3P13797 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLS3P13797 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLS3P13797 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLS3P13797 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLS3P13797 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLS3P13797 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLS3P13797 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLS3P13797 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLS3P13797 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLS3P13797 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLS3P13797 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLS3P13797 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PLS3P13797 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLS3P13797 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLS3P13797 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLS3P13797 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLS3P13797 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PLS3P13797 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PLS3P13797 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLS3P13797 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLS3P13797 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLS3P13797 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLS3P13797 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLS3P13797 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLS3P13797 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLS3P13797 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLS3P13797 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLS3P13797 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLS3P13797 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLS3P13797 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLS3P13797 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLS3P13797 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLS3P13797 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLS3P13797 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLS3P13797 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLS3P13797 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLS3P13797 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLS3P13797 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLS3P13797 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLS3P13797 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLS3P13797 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLS3P13797 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLS3P13797 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLS3P13797 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLS3P13797 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLS3P13797 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLS3P13797 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLS3P13797 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLS3P13797 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLS3P13797 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLS3P13797 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLS3P13797 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PLS3P13797 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PLS3P13797 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLS3P13797 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLS3P13797 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLS3P13797 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLS3P13797 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLS3P13797 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PLS3P13797 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PLS3P13797 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLS3P13797 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLS3P13797 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLS3P13797 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLS3P13797 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLS3P13797 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLS3P13797 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLS3P13797 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PLS3P13797 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PLS3P13797 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLS3P13797 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLS3P13797 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLS3P13797 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS3P13797 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS3P13797 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS3P13797 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS3P13797 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS3P13797 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS3P13797 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS3P13797 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS3P13797 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 725.9 ms