Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCP1P13796 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCP1P13796 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LCP1P13796 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCP1P13796 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCP1P13796 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCP1P13796 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCP1P13796 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCP1P13796 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LCP1P13796 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LCP1P13796 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCP1P13796 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LCP1P13796 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCP1P13796 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCP1P13796 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCP1P13796 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCP1P13796 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCP1P13796 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCP1P13796 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCP1P13796 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCP1P13796 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCP1P13796 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCP1P13796 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCP1P13796 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCP1P13796 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCP1P13796 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCP1P13796 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCP1P13796 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCP1P13796 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCP1P13796 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCP1P13796 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCP1P13796 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCP1P13796 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCP1P13796 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCP1P13796 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCP1P13796 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LCP1P13796 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCP1P13796 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCP1P13796 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCP1P13796 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCP1P13796 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCP1P13796 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCP1P13796 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCP1P13796 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCP1P13796 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCP1P13796 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCP1P13796 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCP1P13796 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCP1P13796 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCP1P13796 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCP1P13796 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCP1P13796 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCP1P13796 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCP1P13796 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCP1P13796 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LCP1P13796 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCP1P13796 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCP1P13796 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCP1P13796 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCP1P13796 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LCP1P13796 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCP1P13796 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCP1P13796 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCP1P13796 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCP1P13796 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCP1P13796 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCP1P13796 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCP1P13796 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCP1P13796 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCP1P13796 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCP1P13796 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCP1P13796 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCP1P13796 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LCP1P13796 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCP1P13796 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCP1P13796 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LCP1P13796 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCP1P13796 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCP1P13796 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LCP1P13796 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCP1P13796 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCP1P13796 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCP1P13796 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCP1P13796 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms