Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFITM1P13164 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFITM1P13164 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms