Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPCP11686 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPCP11686 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPCP11686 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPCP11686 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms