Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP1P11387 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP1P11387 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP1P11387 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP1P11387 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1P11387 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1P11387 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1P11387 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1P11387 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1P11387 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1P11387 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1P11387 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1P11387 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1P11387 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP1P11387 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP1P11387 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP1P11387 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP1P11387 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP1P11387 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP1P11387 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP1P11387 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP1P11387 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP1P11387 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP1P11387 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP1P11387 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP1P11387 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP1P11387 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP1P11387 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP1P11387 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TOP1P11387 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1P11387 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1P11387 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1P11387 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1P11387 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1P11387 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1P11387 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1P11387 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP1P11387 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP1P11387 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP1P11387 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP1P11387 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP1P11387 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP1P11387 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP1P11387 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP1P11387 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1P11387 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1P11387 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1P11387 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1P11387 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1P11387 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1P11387 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1P11387 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP1P11387 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP1P11387 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP1P11387 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP1P11387 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP1P11387 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP1P11387 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP1P11387 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP1P11387 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP1P11387 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP1P11387 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP1P11387 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP1P11387 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP1P11387 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP1P11387 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP1P11387 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP1P11387 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP1P11387 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP1P11387 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP1P11387 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP1P11387 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP1P11387 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP1P11387 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP1P11387 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP1P11387 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP1P11387 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP1P11387 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP1P11387 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP1P11387 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP1P11387 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP1P11387 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP1P11387 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP1P11387 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP1P11387 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP1P11387 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP1P11387 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP1P11387 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP1P11387 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP1P11387 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP1P11387 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP1P11387 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms