Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UMPSP11172 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UMPSP11172 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UMPSP11172 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UMPSP11172 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UMPSP11172 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UMPSP11172 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UMPSP11172 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UMPSP11172 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UMPSP11172 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UMPSP11172 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UMPSP11172 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UMPSP11172 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UMPSP11172 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UMPSP11172 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UMPSP11172 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UMPSP11172 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UMPSP11172 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UMPSP11172 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UMPSP11172 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UMPSP11172 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UMPSP11172 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UMPSP11172 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UMPSP11172 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UMPSP11172 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UMPSP11172 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UMPSP11172 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UMPSP11172 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UMPSP11172 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UMPSP11172 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UMPSP11172 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UMPSP11172 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UMPSP11172 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UMPSP11172 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UMPSP11172 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UMPSP11172 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UMPSP11172 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UMPSP11172 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UMPSP11172 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UMPSP11172 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UMPSP11172 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UMPSP11172 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UMPSP11172 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UMPSP11172 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UMPSP11172 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UMPSP11172 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UMPSP11172 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UMPSP11172 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UMPSP11172 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UMPSP11172 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UMPSP11172 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UMPSP11172 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UMPSP11172 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UMPSP11172 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UMPSP11172 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UMPSP11172 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UMPSP11172 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UMPSP11172 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UMPSP11172 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UMPSP11172 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UMPSP11172 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UMPSP11172 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UMPSP11172 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UMPSP11172 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UMPSP11172 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UMPSP11172 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UMPSP11172 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UMPSP11172 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UMPSP11172 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UMPSP11172 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UMPSP11172 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UMPSP11172 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UMPSP11172 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UMPSP11172 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UMPSP11172 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UMPSP11172 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UMPSP11172 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UMPSP11172 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UMPSP11172 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UMPSP11172 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UMPSP11172 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UMPSP11172 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UMPSP11172 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms