Protein–RNA interactions for Protein: P10721

KIT, Mast/stem cell growth factor receptor Kit, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KITP10721 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KITP10721 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KITP10721 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KITP10721 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KITP10721 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KITP10721 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KITP10721 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KITP10721 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KITP10721 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KITP10721 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KITP10721 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KITP10721 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KITP10721 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KITP10721 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KITP10721 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KITP10721 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KITP10721 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KITP10721 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KITP10721 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KITP10721 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KITP10721 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KITP10721 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KITP10721 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KITP10721 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KITP10721 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KITP10721 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KITP10721 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KITP10721 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KITP10721 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KITP10721 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KITP10721 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KITP10721 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KITP10721 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KITP10721 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KITP10721 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KITP10721 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KITP10721 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KITP10721 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KITP10721 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KITP10721 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KITP10721 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KITP10721 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KITP10721 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KITP10721 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KITP10721 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KITP10721 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KITP10721 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KITP10721 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KITP10721 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KITP10721 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KITP10721 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KITP10721 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KITP10721 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KITP10721 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KITP10721 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KITP10721 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KITP10721 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KITP10721 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KITP10721 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KITP10721 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KITP10721 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KITP10721 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KITP10721 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KITP10721 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KITP10721 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KITP10721 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KITP10721 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KITP10721 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KITP10721 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KITP10721 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KITP10721 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KITP10721 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KITP10721 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KITP10721 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KITP10721 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KITP10721 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KITP10721 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KITP10721 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KITP10721 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KITP10721 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KITP10721 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KITP10721 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KITP10721 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KITP10721 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KITP10721 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KITP10721 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KITP10721 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KITP10721 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KITP10721 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KITP10721 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KITP10721 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms