Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC192P0DO97 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC192P0DO97 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC192P0DO97 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms