Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM10L2AP0DMW4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM10L2AP0DMW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM10L2AP0DMW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM10L2AP0DMW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM10L2AP0DMW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM10L2AP0DMW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM10L2AP0DMW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM10L2AP0DMW4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMIM10L2AP0DMW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMIM10L2AP0DMW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM10L2AP0DMW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms