Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRR29P0C7W0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRR29P0C7W0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRR29P0C7W0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms