Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P2

RFPL3S, Putative protein RFPL3S, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3SP0C7P2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFPL3SP0C7P2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFPL3SP0C7P2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms