Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP1P09455 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP1P09455 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP1P09455 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP1P09455 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP1P09455 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP1P09455 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP1P09455 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP1P09455 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP1P09455 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP1P09455 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP1P09455 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP1P09455 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP1P09455 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBP1P09455 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP1P09455 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP1P09455 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP1P09455 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP1P09455 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP1P09455 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP1P09455 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP1P09455 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP1P09455 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP1P09455 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP1P09455 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP1P09455 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP1P09455 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP1P09455 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP1P09455 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP1P09455 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP1P09455 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP1P09455 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP1P09455 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP1P09455 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP1P09455 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP1P09455 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP1P09455 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBP1P09455 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP1P09455 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP1P09455 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP1P09455 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms