Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL1A2P08123 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL1A2P08123 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL1A2P08123 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms