Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSBP07858 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSBP07858 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSBP07858 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSBP07858 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSBP07858 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSBP07858 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSBP07858 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSBP07858 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSBP07858 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSBP07858 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSBP07858 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSBP07858 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSBP07858 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSBP07858 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSBP07858 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSBP07858 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSBP07858 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSBP07858 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSBP07858 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSBP07858 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSBP07858 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSBP07858 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSBP07858 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSBP07858 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSBP07858 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSBP07858 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSBP07858 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSBP07858 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSBP07858 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSBP07858 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSBP07858 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSBP07858 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSBP07858 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSBP07858 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSBP07858 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSBP07858 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSBP07858 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSBP07858 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSBP07858 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSBP07858 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSBP07858 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSBP07858 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSBP07858 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSBP07858 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSBP07858 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSBP07858 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSBP07858 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSBP07858 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSBP07858 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSBP07858 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSBP07858 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSBP07858 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSBP07858 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSBP07858 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSBP07858 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSBP07858 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSBP07858 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSBP07858 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSBP07858 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSBP07858 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSBP07858 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSBP07858 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSBP07858 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSBP07858 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSBP07858 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSBP07858 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSBP07858 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSBP07858 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSBP07858 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSBP07858 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSBP07858 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSBP07858 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSBP07858 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSBP07858 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSBP07858 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSBP07858 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSBP07858 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSBP07858 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSBP07858 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSBP07858 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSBP07858 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSBP07858 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSBP07858 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSBP07858 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSBP07858 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSBP07858 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSBP07858 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSBP07858 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSBP07858 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSBP07858 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSBP07858 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSBP07858 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSBP07858 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSBP07858 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSBP07858 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms