Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3DP05423 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3DP05423 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3DP05423 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3DP05423 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3DP05423 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 897.4 ms