Protein–RNA interactions for Protein: P04114

APOB, Apolipoprotein B-100, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBP04114 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBP04114 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBP04114 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBP04114 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBP04114 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBP04114 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBP04114 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBP04114 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBP04114 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBP04114 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBP04114 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBP04114 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBP04114 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBP04114 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBP04114 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBP04114 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBP04114 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBP04114 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBP04114 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBP04114 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBP04114 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBP04114 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBP04114 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBP04114 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBP04114 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBP04114 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBP04114 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBP04114 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBP04114 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBP04114 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBP04114 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBP04114 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBP04114 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBP04114 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBP04114 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBP04114 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBP04114 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBP04114 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBP04114 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBP04114 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBP04114 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOBP04114 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBP04114 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBP04114 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBP04114 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBP04114 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBP04114 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBP04114 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBP04114 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBP04114 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBP04114 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBP04114 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBP04114 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBP04114 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBP04114 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBP04114 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBP04114 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBP04114 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBP04114 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBP04114 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBP04114 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBP04114 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBP04114 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBP04114 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBP04114 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBP04114 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBP04114 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBP04114 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBP04114 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBP04114 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBP04114 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms