Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN1LWP04000 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN1LWP04000 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1LWP04000 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms