Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGKV1-17P01599 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGKV1-17P01599 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms