Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CST1P01037 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CST1P01037 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CST1P01037 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST1P01037 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST1P01037 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CST1P01037 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST1P01037 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST1P01037 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST1P01037 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST1P01037 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CST1P01037 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CST1P01037 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CST1P01037 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CST1P01037 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST1P01037 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST1P01037 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST1P01037 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST1P01037 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST1P01037 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CST1P01037 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CST1P01037 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CST1P01037 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CST1P01037 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CST1P01037 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CST1P01037 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CST1P01037 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CST1P01037 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST1P01037 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST1P01037 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST1P01037 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST1P01037 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST1P01037 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST1P01037 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST1P01037 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CST1P01037 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CST1P01037 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CST1P01037 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CST1P01037 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CST1P01037 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CST1P01037 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CST1P01037 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CST1P01037 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST1P01037 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST1P01037 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST1P01037 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST1P01037 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CST1P01037 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CST1P01037 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CST1P01037 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CST1P01037 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CST1P01037 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CST1P01037 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CST1P01037 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST1P01037 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST1P01037 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST1P01037 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST1P01037 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST1P01037 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST1P01037 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CST1P01037 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST1P01037 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CST1P01037 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CST1P01037 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CST1P01037 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CST1P01037 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CST1P01037 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CST1P01037 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST1P01037 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST1P01037 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST1P01037 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST1P01037 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST1P01037 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST1P01037 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST1P01037 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST1P01037 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST1P01037 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CST1P01037 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST1P01037 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST1P01037 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST1P01037 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST1P01037 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST1P01037 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST1P01037 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST1P01037 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST1P01037 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST1P01037 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CST1P01037 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST1P01037 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST1P01037 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST1P01037 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST1P01037 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST1P01037 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST1P01037 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST1P01037 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST1P01037 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST1P01037 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CST1P01037 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CST1P01037 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CST1P01037 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms