Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUDT3O95989 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUDT3O95989 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUDT3O95989 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms