Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR4O95473 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR4O95473 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR4O95473 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms