Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNUPNO95149 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNUPNO95149 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNUPNO95149 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNUPNO95149 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNUPNO95149 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNUPNO95149 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNUPNO95149 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNUPNO95149 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNUPNO95149 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNUPNO95149 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms