Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD3O94806 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD3O94806 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms