Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT38O76015 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT38O76015 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT38O76015 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT38O76015 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT38O76015 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT38O76015 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT38O76015 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT38O76015 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT38O76015 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT38O76015 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT38O76015 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT38O76015 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT38O76015 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT38O76015 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT38O76015 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT38O76015 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT38O76015 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT38O76015 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT38O76015 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT38O76015 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT38O76015 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT38O76015 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT38O76015 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT38O76015 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT38O76015 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT38O76015 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT38O76015 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT38O76015 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT38O76015 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT38O76015 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT38O76015 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT38O76015 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT38O76015 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT38O76015 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT38O76015 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT38O76015 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT38O76015 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT38O76015 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT38O76015 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT38O76015 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT38O76015 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT38O76015 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT38O76015 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT38O76015 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT38O76015 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT38O76015 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT38O76015 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT38O76015 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT38O76015 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT38O76015 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT38O76015 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT38O76015 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT38O76015 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT38O76015 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT38O76015 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT38O76015 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT38O76015 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT38O76015 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT38O76015 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT38O76015 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT38O76015 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT38O76015 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT38O76015 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT38O76015 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT38O76015 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT38O76015 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT38O76015 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT38O76015 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT38O76015 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT38O76015 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT38O76015 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT38O76015 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT38O76015 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT38O76015 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT38O76015 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT38O76015 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT38O76015 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT38O76015 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT38O76015 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT38O76015 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT38O76015 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT38O76015 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms