Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPK1BO75841 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPK1BO75841 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK1BO75841 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPK1BO75841 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms