Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRPA1O75762 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRPA1O75762 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPA1O75762 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPA1O75762 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPA1O75762 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPA1O75762 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPA1O75762 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPA1O75762 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPA1O75762 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRPA1O75762 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPA1O75762 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPA1O75762 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPA1O75762 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPA1O75762 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPA1O75762 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPA1O75762 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPA1O75762 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPA1O75762 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms