Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA2O75334 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA2O75334 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA2O75334 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms