Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP12O75317 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP12O75317 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP12O75317 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP12O75317 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP12O75317 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP12O75317 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP12O75317 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP12O75317 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP12O75317 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP12O75317 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP12O75317 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP12O75317 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP12O75317 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP12O75317 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP12O75317 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP12O75317 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP12O75317 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP12O75317 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP12O75317 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP12O75317 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP12O75317 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP12O75317 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP12O75317 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP12O75317 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP12O75317 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP12O75317 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP12O75317 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP12O75317 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP12O75317 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP12O75317 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP12O75317 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP12O75317 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP12O75317 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP12O75317 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP12O75317 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP12O75317 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP12O75317 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP12O75317 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP12O75317 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP12O75317 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP12O75317 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP12O75317 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP12O75317 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP12O75317 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP12O75317 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP12O75317 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP12O75317 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP12O75317 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP12O75317 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP12O75317 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP12O75317 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP12O75317 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP12O75317 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP12O75317 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP12O75317 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP12O75317 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP12O75317 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP12O75317 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP12O75317 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP12O75317 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP12O75317 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP12O75317 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP12O75317 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP12O75317 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP12O75317 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP12O75317 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP12O75317 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP12O75317 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP12O75317 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP12O75317 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP12O75317 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP12O75317 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP12O75317 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP12O75317 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP12O75317 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP12O75317 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP12O75317 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP12O75317 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP12O75317 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP12O75317 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP12O75317 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP12O75317 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP12O75317 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP12O75317 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP12O75317 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP12O75317 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP12O75317 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP12O75317 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP12O75317 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP12O75317 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms