Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUTAO60888 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUTAO60888 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUTAO60888 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CUTAO60888 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUTAO60888 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUTAO60888 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUTAO60888 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUTAO60888 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUTAO60888 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUTAO60888 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUTAO60888 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUTAO60888 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUTAO60888 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUTAO60888 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUTAO60888 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUTAO60888 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CUTAO60888 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUTAO60888 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUTAO60888 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUTAO60888 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUTAO60888 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CUTAO60888 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUTAO60888 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CUTAO60888 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUTAO60888 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUTAO60888 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUTAO60888 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUTAO60888 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUTAO60888 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUTAO60888 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CUTAO60888 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUTAO60888 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUTAO60888 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUTAO60888 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUTAO60888 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUTAO60888 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUTAO60888 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUTAO60888 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUTAO60888 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUTAO60888 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUTAO60888 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUTAO60888 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUTAO60888 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUTAO60888 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUTAO60888 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUTAO60888 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUTAO60888 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUTAO60888 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CUTAO60888 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUTAO60888 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUTAO60888 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CUTAO60888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CUTAO60888 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUTAO60888 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUTAO60888 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUTAO60888 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUTAO60888 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUTAO60888 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUTAO60888 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUTAO60888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUTAO60888 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUTAO60888 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUTAO60888 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUTAO60888 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUTAO60888 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUTAO60888 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUTAO60888 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUTAO60888 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUTAO60888 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUTAO60888 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUTAO60888 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CUTAO60888 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUTAO60888 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUTAO60888 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CUTAO60888 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CUTAO60888 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUTAO60888 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUTAO60888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUTAO60888 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUTAO60888 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUTAO60888 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUTAO60888 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUTAO60888 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUTAO60888 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUTAO60888 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUTAO60888 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUTAO60888 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUTAO60888 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUTAO60888 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUTAO60888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms