Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.871e-323■■■■■ 57.9
DKC1O60832 TMEM167A-206ENST00000511450 3353 ntTSL 56.52□□□□□ -1.371e-323■■■■■ 57.9
DKC1O60832 TMEM167A-202ENST00000503892 562 ntTSL 45.83□□□□□ -1.481e-323■■■■■ 57.9
DKC1O60832 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.011e-323■■■■■ 57.9
DKC1O60832 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.247e-13■■■■■ 57.9
DKC1O60832 ETFB-203ENST00000593992 603 ntTSL 217.54■□□□□ 0.47e-13■■■■■ 57.9
DKC1O60832 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.397e-13■■■■■ 57.9
DKC1O60832 ETFB-205ENST00000596253 575 ntTSL 316.75■□□□□ 0.277e-13■■■■■ 57.9
DKC1O60832 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.047e-13■■■■■ 57.9
DKC1O60832 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.037e-13■■■■■ 57.9
DKC1O60832 SNHG12-204ENST00000464612 719 ntTSL 1 (best)10.03□□□□□ -0.81e-323■■■■■ 57.9
DKC1O60832 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 57.8
DKC1O60832 PLEKHM3-203ENST00000447645 1915 ntTSL 213.52□□□□□ -0.249e-11■■■■■ 57.8
DKC1O60832 PLEKHM3-204ENST00000457206 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.589e-11■■■■■ 57.8
DKC1O60832 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.999e-11■■■■■ 57.8
DKC1O60832 MCF2L-218ENST00000442625 2710 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 57.8
DKC1O60832 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-16■■■■■ 57.7
DKC1O60832 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-16■■■■■ 57.7
DKC1O60832 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.131e-16■■■■■ 57.7
DKC1O60832 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.841e-16■■■■■ 57.7
DKC1O60832 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 224.99■■□□□ 1.597e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 523.12■■□□□ 1.297e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.267e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.217e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.27e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.17e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 520.46■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.87e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.677e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.677e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.097e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 57.5
DKC1O60832 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.024e-7■■■■■ 57.5
DKC1O60832 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.714e-7■■■■■ 57.5
DKC1O60832 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.494e-7■■■■■ 57.5
DKC1O60832 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 57.5
DKC1O60832 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 413.54□□□□□ -0.241e-10■■■■■ 57.5
DKC1O60832 DCP1A-204ENST00000560076 625 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-70■■■■■ 57.5
DKC1O60832 DCP1A-205ENST00000560624 849 ntTSL 312.6□□□□□ -0.392e-70■■■■■ 57.5
DKC1O60832 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-70■■■■■ 57.5
DKC1O60832 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.122e-70■■■■■ 57.5
DKC1O60832 DCP1A-203ENST00000559748 581 ntTSL 34.95□□□□□ -1.622e-70■■■■■ 57.5
DKC1O60832 IGF2BP1-205ENST00000510023 754 ntTSL 317.84■□□□□ 0.457e-48■■■■■ 57.4
DKC1O60832 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-15■■■■■ 57.4
DKC1O60832 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.11e-15■■■■■ 57.4
DKC1O60832 OSCP1-206ENST00000468441 505 ntTSL 518.4■□□□□ 0.548e-29■■■■■ 57.4
DKC1O60832 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.258e-29■■■■■ 57.4
DKC1O60832 OSCP1-207ENST00000471369 648 ntTSL 214.69□□□□□ -0.068e-29■■■■■ 57.4
DKC1O60832 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.118e-29■■■■■ 57.4
DKC1O60832 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.118e-29■■■■■ 57.4
DKC1O60832 OSCP1-209ENST00000495222 658 ntTSL 314.34□□□□□ -0.118e-29■■■■■ 57.4
DKC1O60832 OSCP1-205ENST00000445843 989 ntTSL 514.16□□□□□ -0.148e-29■■■■■ 57.4
DKC1O60832 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.328e-29■■■■■ 57.4
DKC1O60832 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.278e-25■■■■■ 57.3
DKC1O60832 EIPR1-209ENST00000462515 577 ntTSL 317.64■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 57.3
DKC1O60832 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.313e-7■■■■■ 57.2
DKC1O60832 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 57.1
DKC1O60832 ERICH1-202ENST00000518277 788 ntTSL 218.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 57.1
DKC1O60832 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 57.1
DKC1O60832 TCF7L2-202ENST00000346198 667 ntTSL 37.7□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 57
DKC1O60832 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.916e-8■■■■■ 57
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DKC1O60832 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.766e-8■■■■■ 57
DKC1O60832 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 57
DKC1O60832 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 218.55■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 57
DKC1O60832 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 57
DKC1O60832 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.641e-53■■■■■ 57
DKC1O60832 PTPN4-208ENST00000460289 577 ntTSL 425.85■■□□□ 1.734e-7■■■■■ 56.9
DKC1O60832 PTPN4-211ENST00000488279 662 ntTSL 525.37■■□□□ 1.654e-7■■■■■ 56.9
DKC1O60832 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.513e-8■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ZNF71-203ENST00000599599 783 ntTSL 221.53■■□□□ 1.049e-11■■■■■ 56.9
DKC1O60832 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ATP6V0D1-211ENST00000565835 905 ntTSL 320.02■□□□□ 0.83e-24■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ZNF71-202ENST00000594944 758 ntTSL 319.87■□□□□ 0.779e-11■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.583e-24■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-24■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ATP6V0D1-207ENST00000563305 1656 ntTSL 516.57■□□□□ 0.243e-24■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-24■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.129e-11■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ATP6V0D1-202ENST00000426604 1257 ntTSL 212.62□□□□□ -0.393e-24■■■■■ 56.9
DKC1O60832 ATP6V0D1-217ENST00000568620 3390 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-24■■■■■ 56.9
DKC1O60832 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 56.9
DKC1O60832 PTPN4-210ENST00000485247 590 ntTSL 35.8□□□□□ -1.484e-7■■■■■ 56.9
DKC1O60832 HS6ST1-204ENST00000494089 585 ntTSL 220■□□□□ 0.791e-22■■■■■ 56.7
DKC1O60832 HS6ST1-203ENST00000469019 559 ntTSL 416.93■□□□□ 0.31e-22■■■■■ 56.7
DKC1O60832 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-22■■■■■ 56.7
DKC1O60832 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.542e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-222ENST00000635152 2876 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-210ENST00000547374 3809 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 56.4
DKC1O60832 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 221.15■□□□□ 0.986e-7■■■■■ 56.4
DKC1O60832 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 56.4
DKC1O60832 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 56.4
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