Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL4O60488 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL4O60488 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSL4O60488 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL4O60488 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms