Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNG3O60359 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNG3O60359 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNG3O60359 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms