Protein–RNA interactions for Protein: O60243

HS6ST1, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST1O60243 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HS6ST1O60243 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HS6ST1O60243 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS6ST1O60243 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS6ST1O60243 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms