Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDT21O43809 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDT21O43809 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDT21O43809 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms