Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP2O43734 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3IP2O43734 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3IP2O43734 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms