Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DCXO43602 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCXO43602 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCXO43602 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCXO43602 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCXO43602 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCXO43602 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCXO43602 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DCXO43602 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DCXO43602 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DCXO43602 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCXO43602 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCXO43602 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCXO43602 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCXO43602 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCXO43602 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCXO43602 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCXO43602 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCXO43602 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCXO43602 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCXO43602 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCXO43602 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCXO43602 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCXO43602 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCXO43602 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCXO43602 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCXO43602 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCXO43602 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCXO43602 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCXO43602 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCXO43602 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCXO43602 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCXO43602 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCXO43602 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCXO43602 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCXO43602 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCXO43602 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCXO43602 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCXO43602 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCXO43602 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCXO43602 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCXO43602 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCXO43602 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DCXO43602 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCXO43602 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCXO43602 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCXO43602 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCXO43602 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCXO43602 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCXO43602 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCXO43602 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCXO43602 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCXO43602 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCXO43602 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCXO43602 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DCXO43602 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DCXO43602 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCXO43602 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCXO43602 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DCXO43602 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCXO43602 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCXO43602 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCXO43602 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCXO43602 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCXO43602 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCXO43602 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DCXO43602 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DCXO43602 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCXO43602 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DCXO43602 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCXO43602 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCXO43602 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCXO43602 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCXO43602 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCXO43602 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCXO43602 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCXO43602 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCXO43602 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCXO43602 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCXO43602 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCXO43602 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCXO43602 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCXO43602 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCXO43602 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms