Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT7O43581 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYT7O43581 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT7O43581 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT7O43581 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT7O43581 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYT7O43581 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT7O43581 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT7O43581 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT7O43581 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYT7O43581 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT7O43581 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT7O43581 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT7O43581 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT7O43581 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT7O43581 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYT7O43581 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT7O43581 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT7O43581 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT7O43581 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT7O43581 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYT7O43581 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT7O43581 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT7O43581 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT7O43581 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT7O43581 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT7O43581 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT7O43581 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT7O43581 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT7O43581 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT7O43581 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT7O43581 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT7O43581 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT7O43581 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT7O43581 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT7O43581 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT7O43581 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT7O43581 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT7O43581 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT7O43581 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT7O43581 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT7O43581 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT7O43581 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT7O43581 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT7O43581 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT7O43581 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT7O43581 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT7O43581 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT7O43581 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT7O43581 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT7O43581 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT7O43581 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT7O43581 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT7O43581 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT7O43581 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT7O43581 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT7O43581 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT7O43581 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT7O43581 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT7O43581 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT7O43581 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT7O43581 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT7O43581 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT7O43581 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT7O43581 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT7O43581 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT7O43581 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT7O43581 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT7O43581 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT7O43581 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT7O43581 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT7O43581 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT7O43581 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms