Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK2O43353 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK2O43353 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK2O43353 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIPK2O43353 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK2O43353 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms