Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPINT1O43278 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPINT1O43278 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPINT1O43278 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPINT1O43278 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms