Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSC2O15499 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSC2O15499 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSC2O15499 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSC2O15499 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSC2O15499 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSC2O15499 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSC2O15499 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSC2O15499 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSC2O15499 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSC2O15499 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSC2O15499 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSC2O15499 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSC2O15499 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GSC2O15499 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSC2O15499 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSC2O15499 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSC2O15499 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSC2O15499 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSC2O15499 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSC2O15499 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSC2O15499 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSC2O15499 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSC2O15499 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSC2O15499 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSC2O15499 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSC2O15499 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSC2O15499 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSC2O15499 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSC2O15499 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSC2O15499 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSC2O15499 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSC2O15499 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSC2O15499 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSC2O15499 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSC2O15499 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSC2O15499 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSC2O15499 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSC2O15499 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSC2O15499 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSC2O15499 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSC2O15499 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSC2O15499 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSC2O15499 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSC2O15499 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSC2O15499 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSC2O15499 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSC2O15499 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GSC2O15499 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSC2O15499 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSC2O15499 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSC2O15499 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSC2O15499 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSC2O15499 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSC2O15499 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSC2O15499 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GSC2O15499 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSC2O15499 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSC2O15499 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSC2O15499 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSC2O15499 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSC2O15499 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSC2O15499 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSC2O15499 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms