Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUSKO15146 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUSKO15146 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUSKO15146 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUSKO15146 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MUSKO15146 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUSKO15146 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUSKO15146 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUSKO15146 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MUSKO15146 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MUSKO15146 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUSKO15146 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MUSKO15146 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUSKO15146 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUSKO15146 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUSKO15146 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUSKO15146 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUSKO15146 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUSKO15146 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUSKO15146 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUSKO15146 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUSKO15146 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUSKO15146 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUSKO15146 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUSKO15146 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUSKO15146 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUSKO15146 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUSKO15146 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUSKO15146 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUSKO15146 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUSKO15146 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUSKO15146 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUSKO15146 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUSKO15146 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUSKO15146 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUSKO15146 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUSKO15146 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUSKO15146 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUSKO15146 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUSKO15146 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUSKO15146 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUSKO15146 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MUSKO15146 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUSKO15146 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MUSKO15146 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUSKO15146 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MUSKO15146 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUSKO15146 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUSKO15146 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUSKO15146 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUSKO15146 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUSKO15146 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUSKO15146 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MUSKO15146 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUSKO15146 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUSKO15146 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUSKO15146 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUSKO15146 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUSKO15146 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUSKO15146 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUSKO15146 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUSKO15146 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUSKO15146 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUSKO15146 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUSKO15146 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUSKO15146 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUSKO15146 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MUSKO15146 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MUSKO15146 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUSKO15146 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUSKO15146 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUSKO15146 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUSKO15146 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUSKO15146 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUSKO15146 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUSKO15146 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUSKO15146 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MUSKO15146 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUSKO15146 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUSKO15146 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUSKO15146 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUSKO15146 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUSKO15146 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUSKO15146 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUSKO15146 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUSKO15146 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUSKO15146 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUSKO15146 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUSKO15146 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUSKO15146 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUSKO15146 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUSKO15146 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUSKO15146 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUSKO15146 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUSKO15146 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUSKO15146 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MUSKO15146 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUSKO15146 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUSKO15146 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUSKO15146 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms